בית חב"ד כפר יונה מפעיל מס' בתי כנסת ומוקדי תפילה ברחבי העיר כפר יונה לנוחיות התושבים.
למשכימי קום ישנו מניין שחרית בשעה 6:15 (בימים שני וחמישי ובראשי חודשים ב- 6:05) בבית הכנסת המרכזי, ברחוב יחזקאל ליד הדואר המרכזי.
לפרטים נוספים: 054-9259892 / 050-5552523.
ישנו מניין שחרית נוסף בשעה 8:05 (הודו). התפילה מתקיימת במועדון של הגמלאים הממוקם ברחוב שרת ליד הקניון. מדובר על מניין מאד מרגש ומיוחד המפיח הרבה שמחה ואנרגיה בקשישים.
לפרטים נוספים: 054-6321890 / 054-5573727.
בשבתות ובחגים בבית הכנסת של בית חב"ד תפילת השחרית מתחילה ב- 9:00. לפני כן, בשעה 8:30 במסגרת ההכנה לתפילה מתקיים שיעור מרתק בנושא: התבוננות בגדלות הבורא על פי תורת הסוד.
תפילת המנחה בשבתות וחגים וכפועל יוצא מכך, גם תפילת הערבית משתנה בהתאם לשקיעה ולצאת השבת.
בשבתות וחגים חצי שעה לפני תפילת מנחה מתקיימים שיעורי הלכות. בין מנחה לערבית מועברים שיעורי חסידות.
בראש השנה ויום הכיפורים בית חב"ד כפר יונה מקיים בית כנסת פתוח באווירה מיוחדת לקהל הרחב.
